More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0575 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  81.27 
 
 
299 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  81.27 
 
 
299 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  82.94 
 
 
299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  72.58 
 
 
299 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  72.58 
 
 
299 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  61.95 
 
 
303 aa  374  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  61.72 
 
 
302 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  65.22 
 
 
299 aa  351  8.999999999999999e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  65.22 
 
 
299 aa  351  8.999999999999999e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  44.77 
 
 
296 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  40.97 
 
 
294 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  43.54 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 
232 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  37.63 
 
 
277 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  42.6 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  41.55 
 
 
281 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  43.59 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.2 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  36.05 
 
 
291 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  37.8 
 
 
285 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  43.27 
 
 
276 aa  175  8e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  41.79 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  41.04 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  37.66 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  42.6 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  42.6 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  42.6 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  40.54 
 
 
292 aa  172  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  37 
 
 
296 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  40 
 
 
286 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  41.03 
 
 
281 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  40.28 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  37.32 
 
 
289 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  37.32 
 
 
289 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  37.32 
 
 
289 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.61 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.61 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.61 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  38.49 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.61 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.61 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  34.89 
 
 
270 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  34.89 
 
 
270 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  37.76 
 
 
291 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  37.76 
 
 
291 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  36 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  38.32 
 
 
301 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  38.32 
 
 
301 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  38.54 
 
 
289 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  38.32 
 
 
301 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  37.2 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  37.2 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  37.2 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  37.2 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>