More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5824 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 299 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 299 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  86.62 
 
 		 299 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  81.27 
 
 		 299 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  81.27 
 
 		 299 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  81.68 
 
 		 277 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 		 299 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 		 299 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  61.28 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  61.39 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  66.56 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  66.56 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.57 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.07 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  37.07 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  41.64 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  41.64 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  41.64 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  41.64 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  41.64 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  41.64 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  41.94 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  40.82 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  49.77 
 
 		 232 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  43.17 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  37.24 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  41.75 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  40.49 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  42.14 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1051  Integrase catalytic region  42.23 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  38.68 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  38.28 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  37.03 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0673  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  40.67 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0277  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.213887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0447  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0510  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.384785  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0662  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  36.52 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  36.52 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0068  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0691  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.428791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  36.52 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1486  Integrase catalytic region  39.35 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.000219526  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  38.1 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  38.1 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  38.1 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  38.1 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>