More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5314 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
297 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0510  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.384785  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1486  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.000219526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0662  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0277  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.213887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0673  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0691  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.428791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0068  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0447  Integrase catalytic region  47.29 
 
 
289 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 
296 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  43.87 
 
 
296 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  42.49 
 
 
271 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  43.12 
 
 
281 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 
271 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  39.48 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  40.15 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.76 
 
 
286 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  40.07 
 
 
278 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.91 
 
 
286 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.91 
 
 
286 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.91 
 
 
286 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.91 
 
 
286 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  41.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  37.17 
 
 
270 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  37.17 
 
 
270 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  41.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  37.17 
 
 
270 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  41.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  41.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  41.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  37.17 
 
 
270 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  37.17 
 
 
270 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  36.43 
 
 
270 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  36.43 
 
 
270 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  40.07 
 
 
281 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  41.48 
 
 
319 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.64 
 
 
288 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  41.04 
 
 
283 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.3 
 
 
292 aa  185  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  39.42 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  39.42 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  41.13 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  39.85 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  40.38 
 
 
304 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  39.41 
 
 
294 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
301 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
271 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
271 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 
271 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  41.03 
 
 
288 aa  178  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  38.6 
 
 
286 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  36.92 
 
 
275 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  40.14 
 
 
283 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  40.14 
 
 
283 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  40.66 
 
 
288 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>