More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0068 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0691  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.428791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0068  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0510  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.384785  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0662  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0673  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0277  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.213887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0447  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1486  Integrase catalytic region  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.000219526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  52.31 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  47.29 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  42.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  37.77 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.15 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  39.45 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  41.37 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  36.13 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  34.32 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  34.57 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  34.57 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  35.42 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  35.42 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  35.32 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  38.13 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  37.69 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  35.46 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  38.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  38.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  38.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  38.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  38.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  33.7 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  38.79 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  37.77 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  39.05 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  35.82 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  37.68 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  37.17 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  37.17 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  37.17 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  37.17 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  37.17 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  37.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  32.13 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  32.13 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  35.87 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  38.55 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  34.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  34.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  34.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  34.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  34.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  34.16 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  34.88 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  36.69 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>