More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1051 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1051  Integrase catalytic region  100 
 
 		 331 aa  669    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  90.4 
 
 		 292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  84.8 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  84.8 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  84.8 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  84.8 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  84.8 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  84.8 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  80 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  87.34 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  39.91 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  42.4 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  42.4 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  42.4 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  42.4 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  37.44 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  37.44 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  42.02 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  41.53 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  41.53 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 386 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  40.4 
 
 		 283 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  40.4 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  40.4 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  38.78 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  39.76 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  36.48 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04480  Integrase catalytic region  41.09 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  36.48 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  36.48 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  36.48 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  36.48 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  41.7 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  41.7 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.91 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.91 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.91 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  41.7 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.91 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.91 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  40.59 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  40.59 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  43.37 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  43.37 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  40.59 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  36.21 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  36.21 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  36.21 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  36.21 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  36.21 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  36.21 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  42.34 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  40.42 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  40.42 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  41.43 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  41.43 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  41.43 
 
 		 277 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  37.55 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02981  putative transposase  42.79 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  39.74 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>