More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0673 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  100 
 
 
283 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  90.51 
 
 
296 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  90.51 
 
 
296 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  84.58 
 
 
296 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  84.58 
 
 
296 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  84.58 
 
 
296 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  84.58 
 
 
296 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  72.22 
 
 
263 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  57.42 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  56.81 
 
 
297 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
302 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  56.92 
 
 
291 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  56.92 
 
 
291 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  55.08 
 
 
296 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  56.85 
 
 
289 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  56.85 
 
 
289 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  56.85 
 
 
289 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  53.91 
 
 
296 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  55.87 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  55.6 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  52.94 
 
 
282 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  52.94 
 
 
282 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  52.52 
 
 
282 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  52.52 
 
 
282 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  52.94 
 
 
282 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  55.86 
 
 
231 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  50.2 
 
 
291 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  48.94 
 
 
277 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  50.2 
 
 
286 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  50.2 
 
 
286 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  50.2 
 
 
286 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  50.2 
 
 
286 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  49.8 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  49.21 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  49.21 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  49.21 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  50.2 
 
 
286 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  50.2 
 
 
286 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  49.21 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  49.21 
 
 
286 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0105  integrase catalytic subunit  51.69 
 
 
273 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  51.69 
 
 
273 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
270 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  46.67 
 
 
285 aa  235  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  45.49 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  45.49 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  50.39 
 
 
286 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  45.49 
 
 
302 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  45.49 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  48.73 
 
 
275 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  48.73 
 
 
275 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  48.73 
 
 
275 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  46.03 
 
 
291 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  45.23 
 
 
286 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.86 
 
 
379 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  42.86 
 
 
294 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.78 
 
 
286 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  47.9 
 
 
275 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>