More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2475 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 231 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  79.46 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  79.46 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  79.46 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  79.65 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  79.65 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  71.3 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  70.8 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  65.47 
 
 		 297 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  65.18 
 
 		 296 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  62.78 
 
 		 296 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  62.33 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  58.56 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  58.56 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  58.56 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  58.56 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  57.21 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  57.21 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2445  putative IS3 type transposase integrase (orfB)  64.77 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00380003  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  58.53 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  58.53 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  58.06 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  58.06 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  57.6 
 
 		 282 aa  253  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  55.86 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  59.52 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  52.73 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0105  integrase catalytic subunit  54.25 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  54.25 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  46.23 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  46.23 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.15 
 
 		 379 aa  208  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  49.53 
 
 		 277 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  42.15 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  44.39 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  45.79 
 
 		 275 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  42.99 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  42.99 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  42.99 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  42.99 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  46.61 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  46.61 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  46.61 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  46.61 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  46.61 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 286 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  42.52 
 
 		 272 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  46.61 
 
 		 291 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  47 
 
 		 298 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  47 
 
 		 298 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  47 
 
 		 298 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  42.06 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>