More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2853 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  99.67 
 
 
299 aa  607  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 
299 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 
299 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  83.28 
 
 
299 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  84.25 
 
 
277 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 
299 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 
299 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  62.63 
 
 
303 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  62.38 
 
 
302 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  65.55 
 
 
299 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  65.55 
 
 
299 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  52.97 
 
 
232 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  44.1 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  42.03 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  37.99 
 
 
277 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
292 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
292 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
292 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
292 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
292 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
292 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  43.73 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.75 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  37.07 
 
 
291 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  44.28 
 
 
276 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  41.28 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  41.44 
 
 
292 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  42.54 
 
 
319 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  42.96 
 
 
271 aa  172  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  37.24 
 
 
285 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  42.38 
 
 
304 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
271 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
271 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
271 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  41.64 
 
 
304 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  42.35 
 
 
279 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 
297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  38.49 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1051  Integrase catalytic region  43.03 
 
 
331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  38.62 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  38.83 
 
 
281 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  40.08 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  40.08 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  40.08 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  37.72 
 
 
289 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  39.68 
 
 
291 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  37.72 
 
 
289 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  37.72 
 
 
289 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  37.8 
 
 
286 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  36.51 
 
 
296 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  37.8 
 
 
286 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  37.8 
 
 
286 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  37.8 
 
 
286 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  37.8 
 
 
286 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  34.75 
 
 
279 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>