More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2154 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  72.58 
 
 		 299 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  72.58 
 
 		 299 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  73.99 
 
 		 277 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  69.9 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  63.55 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  63.55 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  40.47 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  41.01 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  39.31 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  37.46 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  39.45 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  36.39 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  40.81 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  40.14 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  40.36 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  44.2 
 
 		 232 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  38.13 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  38.13 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  39.64 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  41.54 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  38.49 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  38.49 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  38.49 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  38.49 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  38.49 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  41.91 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  38.91 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  37.07 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  37.8 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  39.31 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  39.63 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  39.63 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  39.63 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  37.46 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>