More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1118 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  100 
 
 
288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  94.1 
 
 
288 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  82.29 
 
 
288 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  82.29 
 
 
288 aa  497  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  82.29 
 
 
288 aa  497  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  82.29 
 
 
288 aa  497  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  81.94 
 
 
288 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  81.94 
 
 
288 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  82.29 
 
 
298 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  81.25 
 
 
288 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  81.18 
 
 
271 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  80.97 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  94.69 
 
 
207 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  59.72 
 
 
286 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  59.72 
 
 
286 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  59.72 
 
 
286 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  59.72 
 
 
286 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  59.72 
 
 
286 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  82.07 
 
 
194 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  53.87 
 
 
271 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  53.87 
 
 
271 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  53.87 
 
 
271 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  53.87 
 
 
271 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  51.25 
 
 
283 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  54.89 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  54.51 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  65.13 
 
 
200 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  90.85 
 
 
175 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  44.72 
 
 
286 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  44.72 
 
 
286 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  44.72 
 
 
286 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  44.72 
 
 
286 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  44.72 
 
 
286 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
270 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  40.35 
 
 
285 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  41.9 
 
 
286 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  43.01 
 
 
290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  41.7 
 
 
291 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  41.18 
 
 
277 aa  221  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  40.14 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 
289 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  40.14 
 
 
289 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  40.14 
 
 
289 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  40.35 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  40.35 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  40.35 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  40.56 
 
 
291 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  40.56 
 
 
291 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  40.56 
 
 
291 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  39.45 
 
 
296 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  39.45 
 
 
296 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  40.48 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  40.42 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  43.23 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  39.93 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  39.93 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  39.93 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  39.93 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  39.93 
 
 
296 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  40.56 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  41.78 
 
 
291 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  41.78 
 
 
291 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  36.49 
 
 
294 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  41.78 
 
 
291 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.64 
 
 
288 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>