More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0034 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0034  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3008  two component transcriptional regulator  71.1 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.83 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1036  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.715621  normal  0.0491719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.39 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2215  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.72 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.08 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.6 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  43.05 
 
 		 226 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3935  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.52 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.41 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  37.79 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.190199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 239 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  38.25 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.58 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.64 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.64 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.64 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  39.35 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  38.54 
 
 		 229 aa  141  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.73 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.55 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2749  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.513844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  40.54 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  37.96 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  41.55 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.36 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.79 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>