More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0644 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1036  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.79 
 
 		 227 aa  261  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.715621  normal  0.0491719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0034  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.83 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3008  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.32 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.32 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.32 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2215  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.18 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.71 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.18 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 240 aa  141  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.29 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.78 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.78 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  40.78 
 
 		 1629 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 229 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.98 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  39.35 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.49 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  41.26 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.53 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  38.65 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2749  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.513844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.53 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.53 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  40 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.09 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  37.93 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.99 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  41.06 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  44.66 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.28 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  38.92 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  42 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 265 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5762  two component transcriptional regulator  37.79 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120401  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  44.66 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  38.99 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.58 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.72 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0447  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000245325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.96 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  39.13 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.79 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 283 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>