More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2215 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2215  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 229 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  37.27 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.5 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  47 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  40.81 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0034  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  42.27 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  41.82 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  37.05 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2749  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.513844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1231  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  41.26 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.81 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  41.82 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  42.86 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  40.1 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.27 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.56 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  41.3 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  39.46 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.99 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.57 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  35.16 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>