More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5983 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5983  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
541 aa  1049    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.946895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3155  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  43.64 
 
 
550 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3892  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.85 
 
 
550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.0243729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  38.49 
 
 
550 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.82 
 
 
568 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.21 
 
 
557 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.67 
 
 
568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  36.11 
 
 
553 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.81 
 
 
549 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  34.04 
 
 
586 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.22 
 
 
847 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.67 
 
 
573 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.09 
 
 
640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  33.46 
 
 
550 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  33.21 
 
 
548 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  32.55 
 
 
547 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  34.39 
 
 
559 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  31.11 
 
 
847 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.78 
 
 
588 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  32.11 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  33.54 
 
 
570 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.01 
 
 
574 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.85 
 
 
570 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.85 
 
 
570 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.85 
 
 
588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  32.32 
 
 
559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 
586 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  35.63 
 
 
551 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.39 
 
 
562 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  31.22 
 
 
550 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  31.17 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  29.25 
 
 
556 aa  183  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  32.97 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  31.46 
 
 
552 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.78 
 
 
563 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  32.26 
 
 
540 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  32.99 
 
 
586 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.82 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  30.62 
 
 
552 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.24 
 
 
561 aa  178  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.01 
 
 
569 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  30.87 
 
 
548 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  32.65 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.08 
 
 
569 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04345  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
606 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  30.6 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0813  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.13 
 
 
569 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.86 
 
 
558 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  30.67 
 
 
557 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.93 
 
 
573 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.47 
 
 
573 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.42 
 
 
593 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.02 
 
 
563 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.37 
 
 
564 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.07 
 
 
558 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
581 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
581 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.34 
 
 
601 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  27.72 
 
 
558 aa  170  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.73 
 
 
565 aa  170  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.28 
 
 
607 aa  169  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.58 
 
 
582 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.22 
 
 
594 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.48 
 
 
573 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.66 
 
 
574 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  30.67 
 
 
572 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 
552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.62 
 
 
574 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.15 
 
 
598 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
568 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.67 
 
 
580 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.85 
 
 
578 aa  167  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  29.89 
 
 
562 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  29.89 
 
 
562 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  29.89 
 
 
562 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  29.35 
 
 
562 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.16 
 
 
574 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  29.71 
 
 
562 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  29.35 
 
 
565 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.85 
 
 
592 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.42 
 
 
580 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  29.71 
 
 
565 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  29.17 
 
 
565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.34 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.34 
 
 
593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1953  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.97 
 
 
598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.68 
 
 
586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.8 
 
 
581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.34 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  27.13 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  27.11 
 
 
567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  29.17 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.14 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.34 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 
574 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  29.17 
 
 
538 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.14 
 
 
618 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>