More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0544 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  64.27 
 
 
570 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  100 
 
 
586 aa  1167    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.43 
 
 
568 aa  286  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.68 
 
 
549 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  35.6 
 
 
547 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  35.67 
 
 
548 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.65 
 
 
557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.84 
 
 
588 aa  267  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.19 
 
 
573 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  34.81 
 
 
540 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.25 
 
 
568 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  34.01 
 
 
550 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  35.88 
 
 
550 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  34.56 
 
 
540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.25 
 
 
640 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  34.26 
 
 
553 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  34.25 
 
 
559 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.72 
 
 
574 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  32.76 
 
 
586 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.61 
 
 
586 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.23 
 
 
586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  34.22 
 
 
585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  32.16 
 
 
847 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.03 
 
 
847 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  33.58 
 
 
551 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  30.16 
 
 
582 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.08 
 
 
588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.49 
 
 
582 aa  200  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  30.78 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.97 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.71 
 
 
588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.81 
 
 
623 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 
569 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.52 
 
 
570 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.52 
 
 
570 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.05 
 
 
620 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.91 
 
 
586 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  28.3 
 
 
581 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.06 
 
 
561 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 
552 aa  193  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
564 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.21 
 
 
627 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.22 
 
 
563 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  27.34 
 
 
574 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3155  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.2 
 
 
550 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.39 
 
 
597 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  28.18 
 
 
605 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.07 
 
 
598 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.73 
 
 
579 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.9 
 
 
629 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.31 
 
 
567 aa  190  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
564 aa  190  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.27 
 
 
574 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  28.94 
 
 
564 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
564 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5983  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.63 
 
 
541 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.946895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.38 
 
 
581 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
564 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
564 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.75 
 
 
564 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3892  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.02 
 
 
550 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.0243729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  28.94 
 
 
564 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.94 
 
 
564 aa  189  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  29.07 
 
 
544 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.72 
 
 
587 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.81 
 
 
572 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.42 
 
 
554 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.91 
 
 
581 aa  186  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  28.04 
 
 
567 aa  186  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.45 
 
 
633 aa  186  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.18 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.78 
 
 
576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  30.43 
 
 
552 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  28.75 
 
 
578 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.74 
 
 
559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  29.07 
 
 
585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.03 
 
 
562 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.71 
 
 
659 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  26.01 
 
 
547 aa  183  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.42 
 
 
569 aa  183  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 
581 aa  183  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.02 
 
 
580 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  29.44 
 
 
564 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.52 
 
 
565 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.19 
 
 
564 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.52 
 
 
557 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 
566 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.5 
 
 
579 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.7 
 
 
611 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.26 
 
 
584 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.08 
 
 
565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.47 
 
 
608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  28.9 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  29.24 
 
 
626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.96 
 
 
564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.7 
 
 
573 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.22 
 
 
612 aa  180  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.15 
 
 
563 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 
558 aa  180  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>