More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2759 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  77.74 
 
 		 609 aa  915    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  61.61 
 
 		 564 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  61.61 
 
 		 564 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  79.09 
 
 		 569 aa  947    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.61 
 
 		 564 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.38 
 
 		 577 aa  876    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.61 
 
 		 564 aa  686    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.79 
 
 		 564 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.43 
 
 		 564 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.73 
 
 		 583 aa  800    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.25 
 
 		 564 aa  701    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  75.61 
 
 		 576 aa  905    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.73 
 
 		 583 aa  800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 580 aa  1187    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.44 
 
 		 581 aa  862    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  61.61 
 
 		 564 aa  686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.7 
 
 		 581 aa  857    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.11 
 
 		 598 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.6 
 
 		 601 aa  825    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.73 
 
 		 582 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  84.31 
 
 		 579 aa  983    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.28 
 
 		 576 aa  838    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.55 
 
 		 584 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  95.17 
 
 		 580 aa  1120    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.48 
 
 		 584 aa  806    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.61 
 
 		 564 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  51.98 
 
 		 576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  50.53 
 
 		 578 aa  578  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  35.69 
 
 		 605 aa  360  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  29.54 
 
 		 550 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  31.94 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  30.73 
 
 		 847 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.02 
 
 		 568 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  29.66 
 
 		 847 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  29.91 
 
 		 582 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 557 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.23 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  29.72 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  29.78 
 
 		 553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.52 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  28.72 
 
 		 585 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  28.31 
 
 		 550 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.19 
 
 		 612 aa  193  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  28.68 
 
 		 570 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.85 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 		 619 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.93 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.96 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.77 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.65 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.75 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.32 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.1 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2386  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 		 613 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.77 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  28.39 
 
 		 540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.09 
 
 		 592 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.12 
 
 		 588 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  29.02 
 
 		 586 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.37 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 599 aa  182  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.49 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.94 
 
 		 563 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.26 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.35 
 
 		 588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  29.12 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.12 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.12 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  25.66 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 573 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  30.66 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  30.76 
 
 		 570 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.76 
 
 		 570 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  25.31 
 
 		 587 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.7 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  27.05 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  27.22 
 
 		 559 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  25.48 
 
 		 587 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1408  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.33 
 
 		 623 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.77 
 
 		 542 aa  178  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.96 
 
 		 566 aa  178  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.64 
 
 		 570 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.4 
 
 		 589 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  27.13 
 
 		 576 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.14 
 
 		 593 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.75 
 
 		 566 aa  177  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.6 
 
 		 608 aa  176  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.79 
 
 		 570 aa  176  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.32 
 
 		 592 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  26.92 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.35 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  25.13 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.71 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.13 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.87 
 
 		 561 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.19 
 
 		 611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.18 
 
 		 562 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  27.99 
 
 		 626 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.141846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>