More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4838 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.75 
 
 		 564 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  61.11 
 
 		 564 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  61.11 
 
 		 564 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  59.93 
 
 		 582 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  88.67 
 
 		 584 aa  994    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  90.05 
 
 		 601 aa  1044    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.29 
 
 		 580 aa  861    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  75.13 
 
 		 577 aa  866    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 598 aa  1213    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  81.18 
 
 		 576 aa  976    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  61.11 
 
 		 564 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  86.47 
 
 		 581 aa  1033    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  78.35 
 
 		 576 aa  898    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.11 
 
 		 580 aa  873    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.73 
 
 		 581 aa  865    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.11 
 
 		 564 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.93 
 
 		 564 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.11 
 
 		 564 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  76.64 
 
 		 609 aa  893    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.11 
 
 		 564 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  88.08 
 
 		 583 aa  980    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.93 
 
 		 564 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  85.97 
 
 		 584 aa  976    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.03 
 
 		 579 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  88.08 
 
 		 583 aa  980    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.69 
 
 		 569 aa  824    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  53 
 
 		 578 aa  589  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  52.3 
 
 		 576 aa  586  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  34.75 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  30.07 
 
 		 847 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  30.29 
 
 		 550 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  30.25 
 
 		 582 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 568 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  29.04 
 
 		 847 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  33.27 
 
 		 547 aa  223  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  29.69 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  31.67 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  28.6 
 
 		 540 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  30.43 
 
 		 548 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.33 
 
 		 549 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  28.44 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.08 
 
 		 568 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  29.82 
 
 		 570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  27.07 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  29.26 
 
 		 562 aa  200  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.74 
 
 		 573 aa  200  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  29.08 
 
 		 562 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  29.08 
 
 		 565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  28.7 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  28.7 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  28.7 
 
 		 565 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.13 
 
 		 552 aa  197  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  28.88 
 
 		 562 aa  197  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  28.88 
 
 		 562 aa  197  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  28.88 
 
 		 562 aa  197  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.21 
 
 		 582 aa  196  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  28.52 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  26.02 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  26.02 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.34 
 
 		 612 aa  192  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.32 
 
 		 619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.73 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.67 
 
 		 568 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.36 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 		 559 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.09 
 
 		 566 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.49 
 
 		 581 aa  188  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.21 
 
 		 587 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 		 581 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  28.96 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.63 
 
 		 561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.16 
 
 		 561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.55 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  27.65 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  27.08 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.99 
 
 		 565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.21 
 
 		 640 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  27.4 
 
 		 585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.97 
 
 		 557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.2 
 
 		 574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.33 
 
 		 566 aa  184  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.03 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.61 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  26.93 
 
 		 566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.55 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  29.62 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.5 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.37 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.32 
 
 		 579 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.29 
 
 		 620 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.44 
 
 		 608 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.99 
 
 		 566 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26.89 
 
 		 599 aa  180  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.83 
 
 		 561 aa  180  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28 
 
 		 593 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>