More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4360 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  62.61 
 
 
568 aa  763    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  100 
 
 
640 aa  1318    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.54 
 
 
568 aa  531  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  42.08 
 
 
550 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.75 
 
 
549 aa  310  6.999999999999999e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  35.77 
 
 
547 aa  309  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.07 
 
 
586 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.02 
 
 
847 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.43 
 
 
573 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  35.64 
 
 
550 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  34.24 
 
 
586 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  34.49 
 
 
553 aa  296  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  34.78 
 
 
559 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  32.23 
 
 
847 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.62 
 
 
586 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  33.82 
 
 
548 aa  293  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.96 
 
 
574 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  31.76 
 
 
540 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  31.76 
 
 
540 aa  276  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.78 
 
 
557 aa  273  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  32.79 
 
 
551 aa  262  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  32.25 
 
 
586 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  31.91 
 
 
585 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.92 
 
 
588 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.25 
 
 
582 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  30.77 
 
 
570 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.29 
 
 
581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.11 
 
 
581 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.36 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.36 
 
 
570 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.36 
 
 
570 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.16 
 
 
576 aa  228  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  28.7 
 
 
582 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.32 
 
 
574 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.55 
 
 
562 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.67 
 
 
579 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.73 
 
 
552 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 
582 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.24 
 
 
561 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.72 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.72 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 
566 aa  220  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  29.37 
 
 
555 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 
563 aa  219  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  28.95 
 
 
587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  29.23 
 
 
587 aa  218  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.42 
 
 
574 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.06 
 
 
599 aa  216  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.58 
 
 
562 aa  216  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.23 
 
 
562 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.31 
 
 
554 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.13 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.94 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.47 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29.76 
 
 
599 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
588 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 
569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.84 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 
574 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
565 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 
570 aa  213  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.94 
 
 
620 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  29.08 
 
 
587 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.03 
 
 
573 aa  212  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.88 
 
 
587 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.73 
 
 
585 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
563 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.39 
 
 
572 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.47 
 
 
557 aa  212  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  29.76 
 
 
567 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.85 
 
 
566 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  27.11 
 
 
574 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  27.11 
 
 
574 aa  211  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.37 
 
 
574 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0754  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
574 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  30.23 
 
 
586 aa  210  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4678  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.19 
 
 
574 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000775214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.37 
 
 
574 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.32 
 
 
584 aa  210  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.42 
 
 
572 aa  210  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.11 
 
 
574 aa  210  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.11 
 
 
574 aa  210  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.25 
 
 
608 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 
558 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.16 
 
 
604 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.11 
 
 
574 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
574 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.48 
 
 
588 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  30.63 
 
 
622 aa  209  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.03 
 
 
562 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.29 
 
 
572 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.11 
 
 
574 aa  208  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  27.52 
 
 
568 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.67 
 
 
570 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.11 
 
 
592 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 
558 aa  208  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  25.34 
 
 
605 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.11 
 
 
572 aa  207  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.7 
 
 
572 aa  207  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>