More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1796 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  100 
 
 
571 aa  1173    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  93.52 
 
 
571 aa  1111    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  74.26 
 
 
568 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  93.52 
 
 
571 aa  1111    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  74.61 
 
 
568 aa  890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  93.52 
 
 
571 aa  1111    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  91.94 
 
 
573 aa  1097    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3306  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.55 
 
 
588 aa  200  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.29 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  31.92 
 
 
550 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.2 
 
 
557 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.11 
 
 
584 aa  193  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.87 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.92 
 
 
576 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.83 
 
 
568 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.11 
 
 
583 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.11 
 
 
583 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.71 
 
 
569 aa  188  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  27.58 
 
 
547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.23 
 
 
581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  27.4 
 
 
547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.32 
 
 
576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  28.39 
 
 
590 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.9 
 
 
604 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  27.13 
 
 
547 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  28.22 
 
 
547 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  28.19 
 
 
847 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26.61 
 
 
599 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  27.87 
 
 
547 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  27.87 
 
 
547 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  27.87 
 
 
547 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  27.87 
 
 
547 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  27.87 
 
 
547 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  27.85 
 
 
565 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.94 
 
 
588 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  27.93 
 
 
562 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  27.88 
 
 
550 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  27.62 
 
 
546 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  27.69 
 
 
547 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  29.04 
 
 
550 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  25.98 
 
 
584 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.47 
 
 
601 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  27.75 
 
 
565 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.37 
 
 
554 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  25.89 
 
 
552 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.55 
 
 
568 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  26.97 
 
 
546 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  26.97 
 
 
546 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  26.97 
 
 
546 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  26.97 
 
 
546 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  26.8 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.39 
 
 
587 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  26.8 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  26.35 
 
 
547 aa  176  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  27.26 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  27.26 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  26.8 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  27.26 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  27.49 
 
 
562 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  27.62 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.51 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  28.99 
 
 
548 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  27.57 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.29 
 
 
847 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  26.67 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.73 
 
 
557 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 
615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  25.09 
 
 
580 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  26.19 
 
 
546 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  26.95 
 
 
546 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.71 
 
 
640 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  27.47 
 
 
562 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  27.47 
 
 
562 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  27.47 
 
 
562 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.19 
 
 
577 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  27.97 
 
 
548 aa  173  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  26.44 
 
 
546 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  26.77 
 
 
546 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  25.93 
 
 
579 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  26.95 
 
 
546 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  28.22 
 
 
563 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.88 
 
 
552 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  25.27 
 
 
587 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  26.61 
 
 
560 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  25.84 
 
 
546 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26 
 
 
609 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  27.12 
 
 
562 aa  170  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  25.45 
 
 
587 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 
566 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  25.4 
 
 
554 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28.22 
 
 
572 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.03 
 
 
587 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  26.13 
 
 
558 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  26.71 
 
 
622 aa  169  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  26.31 
 
 
550 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  24.6 
 
 
580 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.03 
 
 
576 aa  167  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  28.65 
 
 
582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  26.59 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.45 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>