More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1209 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  60.61 
 
 		 564 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  60.61 
 
 		 564 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  95.88 
 
 		 584 aa  1104    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.61 
 
 		 564 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  75.04 
 
 		 609 aa  853    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  80.14 
 
 		 576 aa  954    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 583 aa  1183    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  73.5 
 
 		 577 aa  836    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.43 
 
 		 564 aa  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.43 
 
 		 564 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 583 aa  1183    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  86.42 
 
 		 584 aa  980    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  59.5 
 
 		 582 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  75.66 
 
 		 576 aa  864    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.73 
 
 		 580 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.83 
 
 		 580 aa  831    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.61 
 
 		 564 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  85.46 
 
 		 601 aa  960    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  68.08 
 
 		 569 aa  791    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.6 
 
 		 581 aa  835    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.61 
 
 		 564 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  89.01 
 
 		 581 aa  1039    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.65 
 
 		 579 aa  822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  88.08 
 
 		 598 aa  983    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.43 
 
 		 564 aa  668    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  60.61 
 
 		 564 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  51.77 
 
 		 576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  52.65 
 
 		 578 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  34.07 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.33 
 
 		 847 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  29.84 
 
 		 550 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  29.38 
 
 		 847 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  32.6 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  32.66 
 
 		 548 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  29.94 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  30.47 
 
 		 582 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  29.94 
 
 		 540 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.02 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  31.42 
 
 		 553 aa  210  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  30.62 
 
 		 559 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.34 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  29.3 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  27.94 
 
 		 571 aa  200  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 573 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.87 
 
 		 640 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 		 563 aa  198  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 568 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.47 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.68 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  30.6 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  27.32 
 
 		 571 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 571 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  27.32 
 
 		 571 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.37 
 
 		 587 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 568 aa  193  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.01 
 
 		 587 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.07 
 
 		 620 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.76 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.77 
 
 		 561 aa  188  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.58 
 
 		 581 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.68 
 
 		 557 aa  187  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 587 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  28.83 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.13 
 
 		 582 aa  187  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.87 
 
 		 581 aa  187  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.13 
 
 		 625 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.77 
 
 		 599 aa  186  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.14 
 
 		 552 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  26.91 
 
 		 542 aa  186  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  28.06 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.69 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.76 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  28.47 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  28.39 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  29.19 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  28.12 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.67 
 
 		 565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.88 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  28.21 
 
 		 562 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  27.24 
 
 		 546 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  27.7 
 
 		 565 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  27.53 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.4 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.01 
 
 		 588 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.27 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.01 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.27 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.29 
 
 		 564 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.27 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  28.52 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  28.52 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.27 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.64 
 
 		 542 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  28.52 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1753  acetolactate synthase, large subunit  27.24 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00232913 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.61 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  27.77 
 
 		 585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>