More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2914 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  79.64 
 
 
550 aa  884    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  66.97 
 
 
553 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  100 
 
 
548 aa  1095    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  66.61 
 
 
559 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  62.66 
 
 
551 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  57.67 
 
 
540 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  56.56 
 
 
540 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  49.82 
 
 
547 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  49.91 
 
 
549 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.77 
 
 
568 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.66 
 
 
568 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  40.45 
 
 
550 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  33.82 
 
 
640 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.44 
 
 
573 aa  296  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.37 
 
 
588 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.46 
 
 
557 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.57 
 
 
574 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  36.17 
 
 
586 aa  276  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  35.13 
 
 
570 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.1 
 
 
586 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  33.9 
 
 
586 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  34.18 
 
 
585 aa  256  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.35 
 
 
586 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  33.7 
 
 
847 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  34.06 
 
 
582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.84 
 
 
847 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  32.04 
 
 
581 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.04 
 
 
577 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.21 
 
 
584 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.22 
 
 
576 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.92 
 
 
584 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.39 
 
 
583 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.39 
 
 
583 aa  217  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.9 
 
 
555 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.96 
 
 
579 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.15 
 
 
576 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.28 
 
 
564 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.72 
 
 
580 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  28.67 
 
 
567 aa  209  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.91 
 
 
581 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.93 
 
 
581 aa  207  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 
604 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.75 
 
 
581 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
598 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.69 
 
 
559 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.4 
 
 
609 aa  203  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.83 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.3 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26.81 
 
 
599 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.76 
 
 
563 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.98 
 
 
569 aa  200  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.04 
 
 
615 aa  199  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  30.09 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  30.09 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.02 
 
 
580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.09 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.27 
 
 
588 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.5 
 
 
554 aa  198  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.12 
 
 
573 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.97 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.49 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  27.82 
 
 
566 aa  197  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.62 
 
 
561 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0875  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.24 
 
 
608 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.37 
 
 
636 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.41 
 
 
574 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.15 
 
 
559 aa  196  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  28.03 
 
 
574 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.04 
 
 
574 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.4 
 
 
582 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  28.98 
 
 
577 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.96 
 
 
542 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.36 
 
 
566 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.01 
 
 
564 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  28.65 
 
 
591 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  27.42 
 
 
562 aa  194  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  28.24 
 
 
560 aa  193  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  26.48 
 
 
605 aa  193  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.06 
 
 
573 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.09 
 
 
561 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.27 
 
 
573 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.9 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  28.24 
 
 
569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5983  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.47 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.946895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.1 
 
 
558 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  28.24 
 
 
622 aa  190  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.1 
 
 
569 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.68 
 
 
552 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.48 
 
 
562 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  26.92 
 
 
569 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.27 
 
 
563 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3892  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.11 
 
 
550 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.0243729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>