More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2104 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.72 
 
 
573 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
588 aa  1172    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.17 
 
 
574 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  53.79 
 
 
585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  52.8 
 
 
586 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  52.3 
 
 
586 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  52.07 
 
 
586 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.24 
 
 
568 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  38.73 
 
 
550 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.72 
 
 
568 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  35.2 
 
 
548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  36.36 
 
 
553 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.02 
 
 
549 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  34.75 
 
 
550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  35.4 
 
 
559 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  33.84 
 
 
586 aa  267  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  34.48 
 
 
540 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  33.22 
 
 
540 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.92 
 
 
640 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  32.35 
 
 
547 aa  243  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  34.43 
 
 
551 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  31.56 
 
 
570 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.35 
 
 
557 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.2 
 
 
847 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.8 
 
 
588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  30.62 
 
 
570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.62 
 
 
570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.48 
 
 
847 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  29.81 
 
 
582 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3155  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  31.69 
 
 
550 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5983  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.92 
 
 
541 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.946895 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.18 
 
 
569 aa  177  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3892  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.76 
 
 
550 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.0243729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.54 
 
 
574 aa  171  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 
574 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.34 
 
 
574 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  29.83 
 
 
579 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.34 
 
 
574 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  26.34 
 
 
574 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  26.34 
 
 
574 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.91 
 
 
584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  26.32 
 
 
562 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.47 
 
 
570 aa  167  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 
561 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.26 
 
 
604 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.17 
 
 
574 aa  166  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.47 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.59 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.91 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.17 
 
 
574 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.75 
 
 
584 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.85 
 
 
593 aa  164  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.08 
 
 
569 aa  163  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.51 
 
 
563 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.59 
 
 
584 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  28.49 
 
 
554 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  26 
 
 
565 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.26 
 
 
581 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.77 
 
 
592 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.72 
 
 
594 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.25 
 
 
572 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  27.72 
 
 
562 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  27.72 
 
 
562 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  27.72 
 
 
562 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  27.72 
 
 
562 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  27.72 
 
 
562 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  25.65 
 
 
562 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.47 
 
 
562 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  25.48 
 
 
565 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.1 
 
 
574 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  25.65 
 
 
565 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  24.32 
 
 
566 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  25.65 
 
 
562 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  23.97 
 
 
566 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.71 
 
 
612 aa  158  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.72 
 
 
559 aa  158  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  27.18 
 
 
562 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.36 
 
 
574 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  26.24 
 
 
562 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.88 
 
 
588 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  26.24 
 
 
562 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  26.24 
 
 
562 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.49 
 
 
586 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.04 
 
 
558 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.53 
 
 
576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  27.18 
 
 
562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  27.18 
 
 
562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  25.48 
 
 
562 aa  157  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.19 
 
 
574 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.23 
 
 
581 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  23.46 
 
 
566 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  23.63 
 
 
569 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  23.63 
 
 
566 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  25.71 
 
 
573 aa  156  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  23.29 
 
 
566 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.91 
 
 
566 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  27.37 
 
 
549 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.1 
 
 
575 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.61 
 
 
549 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.81 
 
 
619 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>