More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3618 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.58 
 
 		 584 aa  830    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  63.44 
 
 		 564 aa  708    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  63.44 
 
 		 564 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  63.44 
 
 		 564 aa  708    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  79.09 
 
 		 569 aa  951    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  63.26 
 
 		 564 aa  707    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  75.57 
 
 		 577 aa  900    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 579 aa  1186    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  63.44 
 
 		 564 aa  708    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.05 
 
 		 581 aa  860    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.22 
 
 		 581 aa  859    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  63.44 
 
 		 564 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  63.44 
 
 		 564 aa  708    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.65 
 
 		 583 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.15 
 
 		 601 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  83.97 
 
 		 580 aa  999    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.35 
 
 		 576 aa  887    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  84.31 
 
 		 580 aa  1025    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  59.68 
 
 		 582 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  63.44 
 
 		 564 aa  708    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.9 
 
 		 584 aa  821    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  73.69 
 
 		 609 aa  890    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.85 
 
 		 576 aa  846    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.65 
 
 		 583 aa  816    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.03 
 
 		 598 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  63.62 
 
 		 564 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  50.99 
 
 		 576 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  51.08 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  34.34 
 
 		 605 aa  359  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  30.52 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  31.33 
 
 		 547 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  30.22 
 
 		 847 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  29.13 
 
 		 550 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 568 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.52 
 
 		 568 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.73 
 
 		 847 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  28.97 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.48 
 
 		 640 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.52 
 
 		 565 aa  206  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  28.25 
 
 		 550 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.47 
 
 		 619 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  30.31 
 
 		 570 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  29.7 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.83 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.83 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.83 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.27 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.26 
 
 		 581 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.64 
 
 		 581 aa  196  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  27.66 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.29 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  27.84 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  28.32 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  28.1 
 
 		 540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  27.36 
 
 		 540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.65 
 
 		 542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.72 
 
 		 563 aa  190  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  29.5 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  27.48 
 
 		 565 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  27.66 
 
 		 565 aa  190  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 568 aa  190  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 568 aa  190  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  30.22 
 
 		 551 aa  190  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  27.48 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  27.48 
 
 		 562 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  27.48 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  27.48 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  27.45 
 
 		 565 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.21 
 
 		 565 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.93 
 
 		 599 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.94 
 
 		 564 aa  187  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.89 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  27.4 
 
 		 562 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 		 554 aa  186  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  27.38 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.44 
 
 		 632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.27 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.21 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.98 
 
 		 588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.54 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.39 
 
 		 608 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  25.93 
 
 		 571 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.36 
 
 		 587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.05 
 
 		 592 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.78 
 
 		 579 aa  183  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.2 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.81 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  30.07 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.68 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.69 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.04 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.36 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.06 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.4 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.05 
 
 		 593 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.5 
 
 		 570 aa  181  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.36 
 
 		 559 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>