More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0486 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  61.65 
 
 		 564 aa  675    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  61.65 
 
 		 564 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.47 
 
 		 564 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  84.06 
 
 		 601 aa  939    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  86.97 
 
 		 584 aa  971    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.07 
 
 		 577 aa  845    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  85.97 
 
 		 598 aa  955    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.65 
 
 		 564 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 584 aa  1183    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.58 
 
 		 579 aa  814    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  72.42 
 
 		 580 aa  843    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.6 
 
 		 609 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  75.18 
 
 		 576 aa  855    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.55 
 
 		 580 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  86.42 
 
 		 583 aa  957    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  82.96 
 
 		 581 aa  988    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  71.71 
 
 		 581 aa  813    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.65 
 
 		 564 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  86.42 
 
 		 583 aa  957    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.85 
 
 		 582 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  61.65 
 
 		 564 aa  675    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.47 
 
 		 564 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.65 
 
 		 564 aa  675    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  80.91 
 
 		 576 aa  967    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  69.04 
 
 		 569 aa  806    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  61.29 
 
 		 564 aa  688    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  53.16 
 
 		 576 aa  594  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  53.31 
 
 		 578 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  35.14 
 
 		 605 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  31.08 
 
 		 847 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  30.76 
 
 		 847 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.41 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  31.52 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  29.5 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  30.35 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.44 
 
 		 568 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  31.21 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  29.58 
 
 		 540 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  29.76 
 
 		 540 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  30.23 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.83 
 
 		 549 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  28.81 
 
 		 550 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.19 
 
 		 640 aa  203  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.96 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.38 
 
 		 612 aa  198  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.16 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  30.29 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.12 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.13 
 
 		 619 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.98 
 
 		 581 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  28.3 
 
 		 585 aa  193  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  28.55 
 
 		 544 aa  193  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.82 
 
 		 599 aa  193  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.9 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 573 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  29.08 
 
 		 570 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.07 
 
 		 561 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  28 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.79 
 
 		 582 aa  190  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 		 587 aa  191  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 		 559 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.7 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  27.03 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  28.93 
 
 		 555 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.1 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  26.51 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.51 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.65 
 
 		 568 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  26.51 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.86 
 
 		 557 aa  187  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.55 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.88 
 
 		 611 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.08 
 
 		 588 aa  186  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.69 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  29.36 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.45 
 
 		 558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  25.98 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.12 
 
 		 620 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  26.96 
 
 		 578 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  30.07 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.06 
 
 		 618 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.78 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  24.73 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.49 
 
 		 564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  29.83 
 
 		 551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2386  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.92 
 
 		 613 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.14 
 
 		 593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  25.71 
 
 		 587 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.89 
 
 		 565 aa  184  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 		 554 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  28.65 
 
 		 569 aa  183  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 		 566 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.85 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.58 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>