More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3698 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  75.13 
 
 		 571 aa  899    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1167    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  95.07 
 
 		 568 aa  1117    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  74.26 
 
 		 571 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  75.13 
 
 		 571 aa  899    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  75.13 
 
 		 571 aa  899    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  72.5 
 
 		 573 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  29.26 
 
 		 547 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  28.72 
 
 		 547 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  28.72 
 
 		 547 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  28.72 
 
 		 547 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  28.9 
 
 		 547 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  28.55 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  28.55 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  28.55 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  28.9 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3306  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  28.2 
 
 		 547 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 557 aa  204  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.78 
 
 		 847 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.19 
 
 		 581 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.54 
 
 		 568 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  29.11 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.19 
 
 		 847 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.61 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  27.13 
 
 		 547 aa  190  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 565 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  28.6 
 
 		 562 aa  189  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  28.62 
 
 		 565 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 562 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 562 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 562 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 562 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27 
 
 		 569 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  28.6 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.92 
 
 		 576 aa  187  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  28.65 
 
 		 560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  28.23 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  28.6 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  26.07 
 
 		 546 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.85 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.21 
 
 		 577 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26.91 
 
 		 599 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  29.38 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.39 
 
 		 609 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  27.21 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  28.34 
 
 		 547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.53 
 
 		 546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.47 
 
 		 640 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.02 
 
 		 576 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  26.37 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.75 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.79 
 
 		 584 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.75 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  25.89 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.19 
 
 		 580 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  27.81 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.03 
 
 		 598 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  29.04 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  27.37 
 
 		 582 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  26.06 
 
 		 546 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.21 
 
 		 584 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  25.53 
 
 		 550 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  27.01 
 
 		 548 aa  180  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.24 
 
 		 579 aa  180  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.45 
 
 		 554 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  25.99 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.34 
 
 		 580 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  28.36 
 
 		 558 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.62 
 
 		 581 aa  178  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  25.36 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  25.53 
 
 		 550 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  25.8 
 
 		 546 aa  177  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  26.16 
 
 		 550 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  26.4 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  25.54 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  25.54 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  25.54 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  25.67 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  28.44 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  28.44 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  25.18 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.81 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.68 
 
 		 587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.47 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  27.6 
 
 		 547 aa  174  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  26.92 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.93 
 
 		 610 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  27.22 
 
 		 550 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  27.51 
 
 		 583 aa  173  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.63 
 
 		 601 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.93 
 
 		 610 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  25.59 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.85 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>