More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4937 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4937  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1423  hypothetical protein  29.91 
 
 
229 aa  93.2  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  31.84 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.34 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
373 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
379 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  39.45 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  30.3 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  32.13 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  35.37 
 
 
370 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.62 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  41 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  28.31 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
352 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.88 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
376 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.88 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
357 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  27.36 
 
 
358 aa  59.3  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.47 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
367 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
380 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.95 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.69 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.95 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  26.5 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.05 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  26 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.65 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.97 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  31.69 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  29.59 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  36.04 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.97 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
381 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 
388 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  27.49 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2066  oxidoreductase-like  37.14 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.67 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  28.96 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  27.36 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  35.22 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
344 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
667 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 
356 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.22 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  32.3 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  32.77 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.3 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  31.45 
 
 
474 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  33.92 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
667 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.26 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.08 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  19.76 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  33.17 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
667 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>