83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1550 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 463 aa  928    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  90.66 
 
 		 471 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  92.87 
 
 		 463 aa  868    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  92.87 
 
 		 463 aa  870    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.81 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.95 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.73 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.53 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.03 
 
 		 468 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.44 
 
 		 475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.49 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.2 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  44.69 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.39 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.88 
 
 		 477 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  44.93 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  43.33 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  60 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  61 
 
 		 314 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  58.8 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  59.76 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  59.76 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  60.34 
 
 		 315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  60.58 
 
 		 293 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  58.4 
 
 		 310 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  60 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  58.57 
 
 		 309 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  59.24 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  60.08 
 
 		 310 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  59.58 
 
 		 310 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  59.58 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  57.03 
 
 		 306 aa  292  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  59.34 
 
 		 310 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  54 
 
 		 308 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  58.75 
 
 		 310 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  55.02 
 
 		 305 aa  289  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  58.23 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  57.92 
 
 		 310 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  57.92 
 
 		 310 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  57.92 
 
 		 310 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  53.61 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  57.5 
 
 		 307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  51.75 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  53.75 
 
 		 308 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4891  cyclic nucleotide-binding  77.78 
 
 		 95 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.646352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  34.51 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  37.37 
 
 		 225 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  34.91 
 
 		 166 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 249 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  33.75 
 
 		 169 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 157 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.11 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.18 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  27.73 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  33.33 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  28.03 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 167 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 250 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 232 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  35.56 
 
 		 1124 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 490 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 155 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 493 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 248 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 479 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>