82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1255 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 473 aa  972    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.75 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.97 
 
 		 461 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.8 
 
 		 471 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.53 
 
 		 468 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.39 
 
 		 467 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.92 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  62 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  61.02 
 
 		 467 aa  579  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  59.69 
 
 		 465 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.25 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.53 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.6 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  52.01 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  46.81 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  47.03 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  47.03 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  46.22 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  59.83 
 
 		 308 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  57.08 
 
 		 306 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  57.26 
 
 		 309 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  55.25 
 
 		 305 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  54.09 
 
 		 308 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  57.56 
 
 		 306 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  56.72 
 
 		 310 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  56.72 
 
 		 310 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  59.29 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  55.04 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  51.06 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  54.47 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  53.44 
 
 		 314 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  56.3 
 
 		 307 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  58.08 
 
 		 310 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  57.64 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  57.64 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  57.64 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  55.28 
 
 		 310 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  56.25 
 
 		 306 aa  282  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  55.28 
 
 		 310 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  57.64 
 
 		 293 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  58.08 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  55.04 
 
 		 308 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  55.04 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  55.04 
 
 		 308 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  50.43 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 246 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  26.53 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  26.51 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.87 
 
 		 222 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  28.45 
 
 		 241 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 860 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.57 
 
 		 239 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.07 
 
 		 226 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  29.52 
 
 		 346 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  35.96 
 
 		 265 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4891  cyclic nucleotide-binding  41.82 
 
 		 95 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.646352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  35.96 
 
 		 265 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5709  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.72 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.18214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 		 224 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  28.85 
 
 		 575 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 563 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 234 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 236 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  25.47 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 232 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>