79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6907 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.59 
 
 		 468 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  69.49 
 
 		 471 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  69.87 
 
 		 467 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.55 
 
 		 469 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 461 aa  942    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.33 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  67.98 
 
 		 470 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.94 
 
 		 475 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.78 
 
 		 472 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.97 
 
 		 473 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.55 
 
 		 483 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.77 
 
 		 477 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  60.67 
 
 		 465 aa  541  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  56.82 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  45.73 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  45.95 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  45.51 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  43.87 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  56.05 
 
 		 306 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  57.08 
 
 		 314 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  55.65 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  54.92 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  57.32 
 
 		 314 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  55.79 
 
 		 308 aa  269  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  54.47 
 
 		 305 aa  266  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  53.33 
 
 		 305 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  53.56 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  53.2 
 
 		 309 aa  259  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  54.25 
 
 		 306 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  54.62 
 
 		 310 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  54.62 
 
 		 310 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  51.94 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  54.07 
 
 		 307 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  51.43 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  51.42 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  51.42 
 
 		 310 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  51.82 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  51.42 
 
 		 310 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  51.42 
 
 		 310 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  51.42 
 
 		 310 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  52.32 
 
 		 310 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  51.68 
 
 		 308 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  53.04 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  48.74 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 254 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 		 228 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11692  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 244 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.476097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 		 226 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  28.07 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 		 860 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 236 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  28.35 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0642  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.37 
 
 		 226 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 236 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 		 224 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 		 224 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 263 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 		 231 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.17 
 
 		 222 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>