75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1992 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 472 aa  961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.44 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.78 
 
 		 461 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.8 
 
 		 468 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.75 
 
 		 473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.88 
 
 		 467 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  63.16 
 
 		 467 aa  587  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  62.58 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.16 
 
 		 475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.7 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.84 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.04 
 
 		 477 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  57.78 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  55.44 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  44.73 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  44.75 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  44.97 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  43.34 
 
 		 471 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  59.13 
 
 		 306 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  56.38 
 
 		 308 aa  289  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  56.49 
 
 		 314 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  55.14 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  55.42 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  53.91 
 
 		 310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  53.88 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  56.02 
 
 		 309 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  54.25 
 
 		 305 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  55.33 
 
 		 307 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  54.73 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  54.73 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  55.92 
 
 		 305 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  55.42 
 
 		 306 aa  279  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  53.36 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  53.91 
 
 		 308 aa  273  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  53.25 
 
 		 310 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  53.25 
 
 		 310 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  55 
 
 		 310 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  54.58 
 
 		 293 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  54.66 
 
 		 310 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  54.66 
 
 		 310 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  54.66 
 
 		 310 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  52.44 
 
 		 310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  54.36 
 
 		 308 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  53.31 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  48.8 
 
 		 314 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 239 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.66 
 
 		 220 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 249 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.15 
 
 		 223 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  34.65 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 164 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.83 
 
 		 219 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 236 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30 
 
 		 225 aa  47  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  29.2 
 
 		 216 aa  46.6  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 236 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 236 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 225 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5713  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0248  cyclic nucleotide-binding  31.06 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 177 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  29.17 
 
 		 322 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 249 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>