75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5017 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.55 
 
 		 461 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 469 aa  954    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.61 
 
 		 468 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.83 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  67.04 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  65.05 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.33 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.92 
 
 		 473 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.03 
 
 		 475 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.89 
 
 		 483 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.7 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  57.11 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.68 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  55.88 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  45.2 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  44.74 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  44.74 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  54.92 
 
 		 315 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  54.25 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  53.44 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  54.17 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  54.39 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  53.23 
 
 		 306 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  50.19 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  54.62 
 
 		 309 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  50.59 
 
 		 305 aa  262  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  53.53 
 
 		 310 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  53.53 
 
 		 310 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  52.65 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  52.85 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  50.62 
 
 		 310 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  52 
 
 		 310 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  52 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  51.09 
 
 		 306 aa  257  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  52.4 
 
 		 310 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  53.31 
 
 		 293 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  52 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  52 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  52 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  52.82 
 
 		 307 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  52.89 
 
 		 310 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  49.58 
 
 		 308 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  48.78 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  45.14 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.95 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 236 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 236 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.65 
 
 		 219 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 218 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 222 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.55 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  30.49 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0065  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0605636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.29 
 
 		 227 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37.14 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 228 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>