58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1444 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 475 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.53 
 
 		 483 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.94 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.91 
 
 		 477 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.49 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.03 
 
 		 469 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.16 
 
 		 472 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.48 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  60.43 
 
 		 467 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.25 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  61.47 
 
 		 470 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.53 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  57.27 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  55.68 
 
 		 455 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  46.44 
 
 		 463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  46.65 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  46.65 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  45.42 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  55.51 
 
 		 308 aa  279  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  56.33 
 
 		 306 aa  272  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  53.28 
 
 		 315 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  57.64 
 
 		 305 aa  269  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  54.36 
 
 		 314 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  54.39 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  53.88 
 
 		 309 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  53.47 
 
 		 307 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  53.5 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  52.67 
 
 		 305 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  53.06 
 
 		 306 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  52.02 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  52.24 
 
 		 310 aa  260  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  52.24 
 
 		 310 aa  260  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  51.22 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  51.84 
 
 		 308 aa  256  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  51.22 
 
 		 310 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  50.2 
 
 		 310 aa  256  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  51.22 
 
 		 310 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  51.22 
 
 		 310 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  51.22 
 
 		 310 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  50 
 
 		 310 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  50.81 
 
 		 310 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  49.8 
 
 		 308 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  51.05 
 
 		 310 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  50.63 
 
 		 293 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  46.83 
 
 		 314 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  29.41 
 
 		 583 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4891  cyclic nucleotide-binding  51.35 
 
 		 95 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.646352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  27.2 
 
 		 231 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 236 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 236 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>