67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5016 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.59 
 
 		 461 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 468 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.61 
 
 		 469 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.7 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.8 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  64.87 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.53 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.19 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  64.1 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.32 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.53 
 
 		 475 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.96 
 
 		 477 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  55.31 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  54.91 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  44.03 
 
 		 463 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  44.03 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  43.82 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  42.52 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  53.39 
 
 		 305 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  52.55 
 
 		 308 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  53.28 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  55.42 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  52.14 
 
 		 306 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  51.35 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  55.42 
 
 		 306 aa  279  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  52.73 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  52.92 
 
 		 310 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  51.87 
 
 		 314 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  52.36 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  51.67 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  52.92 
 
 		 310 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  52.92 
 
 		 310 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  53.12 
 
 		 307 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  51.36 
 
 		 310 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  50.58 
 
 		 310 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  50.58 
 
 		 308 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  51.36 
 
 		 310 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  51.17 
 
 		 308 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  53.16 
 
 		 310 aa  263  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  52.74 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  47.49 
 
 		 314 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.76 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 222 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 239 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 		 219 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 		 236 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.32 
 
 		 563 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 236 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  33.01 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 239 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 253 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>