83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0762 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5558  cyclic nucleotide-binding protein  68.21 
 
 		 470 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 471 aa  979    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4230  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 467 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6907  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  69.49 
 
 		 461 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1992  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.44 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5017  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.83 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.54 
 
 		 467 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5016  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.7 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1255  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.8 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5920  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.16 
 
 		 483 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0557549  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1444  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.49 
 
 		 475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4615  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60 
 
 		 477 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.465429  hitchhiker  0.0000920675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1256  cyclic nucleotide-binding protein  56.67 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1993  cyclic nucleotide-binding protein  54.03 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  43.07 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1428  cyclic nucleotide-binding protein  42.31 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.770686  hitchhiker  0.00000483359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1550  cyclic nucleotide-binding protein  42.39 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.971119  normal  0.0601596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2040  hypothetical protein  55.16 
 
 		 306 aa  282  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5683  hypothetical protein  54.37 
 
 		 308 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3636  hypothetical protein  52.65 
 
 		 315 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.0625482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1814  hypothetical protein  52.78 
 
 		 305 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0199581  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0489  hypothetical protein  53.47 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0616  major membrane protein I  52.4 
 
 		 305 aa  267  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00347631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3228  hypothetical protein  53.72 
 
 		 314 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1607  SRPI protein  54.13 
 
 		 314 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16680  hypothetical protein  53.53 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20990  hypothetical protein  53.53 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0886304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4654  hypothetical protein  54.77 
 
 		 306 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00254851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0024  hypothetical protein  51.59 
 
 		 309 aa  263  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1233  hypothetical protein  54.32 
 
 		 307 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0702713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2494  hypothetical protein  52.7 
 
 		 310 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2662  major membrane protein I  52.38 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0668871  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5791  major membrane protein I  53.04 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608599 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0123  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1553  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0449  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1408  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1819  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0932  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1905  major membrane protein I  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0363  major membrane protein I  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0198  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4002  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3516  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2623  hypothetical protein  50.59 
 
 		 310 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1893  major membrane protein I  53.02 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5204  hypothetical protein  51.01 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0755  hypothetical protein  49.21 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.778519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0542  hypothetical protein  52.59 
 
 		 293 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1685  hypothetical protein  46.41 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  32.14 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.22 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.95 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 		 223 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1887  FNR/CRP family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 216 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000504679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 		 239 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.82 
 
 		 225 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 236 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 232 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  26.61 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.46 
 
 		 225 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.46 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 		 222 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 236 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 563 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 225 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 		 248 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 		 228 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 503 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 236 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 225 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 225 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>