More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0920 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0903  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0920  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
413 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  98.31 
 
 
413 aa  779    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  72.71 
 
 
415 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  72.48 
 
 
417 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  28.87 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  28.61 
 
 
425 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.46 
 
 
418 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.14 
 
 
419 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.33 
 
 
410 aa  106  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.65 
 
 
429 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.33 
 
 
446 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  29.93 
 
 
410 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
409 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.13 
 
 
447 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.08 
 
 
418 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5471  major facilitator transporter  29.08 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  28.8 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5391  major facilitator transporter  29.08 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667839  normal  0.033436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4699  major facilitator transporter  28.07 
 
 
412 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4879  major facilitator transporter  28.8 
 
 
412 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
453 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  30.11 
 
 
419 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  27.75 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.49 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.65 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  29.24 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
433 aa  92.8  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.98 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.98 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.84 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.84 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
403 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.99 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.18 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.16 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.37 
 
 
474 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  30.5 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  28.35 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  28.99 
 
 
586 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
401 aa  87  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  25.62 
 
 
431 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  27.15 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  23.45 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  25.89 
 
 
542 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  26.63 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.52 
 
 
450 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  25.72 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  29.19 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  28.43 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.45 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  28.33 
 
 
557 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  23.51 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  23.2 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  30.68 
 
 
555 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  23.26 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  23.2 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  22.94 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  22.68 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.86 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  27.87 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.36 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.98 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  22.94 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  28.95 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  29.89 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  31.25 
 
 
535 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  23.2 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.66 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  27.32 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  29.1 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.47 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  26.23 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  27.3 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  28.38 
 
 
532 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  21.31 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  28.12 
 
 
553 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  30.94 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  26.29 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>