268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6034 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4699  major facilitator transporter  90.78 
 
 
412 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4879  major facilitator transporter  92.72 
 
 
412 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5471  major facilitator transporter  92.48 
 
 
412 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5391  major facilitator transporter  92.48 
 
 
412 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667839  normal  0.033436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  26.05 
 
 
413 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.08 
 
 
430 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
409 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  31.38 
 
 
435 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.32 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.82 
 
 
447 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  29.44 
 
 
425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  29.44 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.66 
 
 
446 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.65 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.98 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.58 
 
 
410 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
418 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
413 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
440 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  29.15 
 
 
419 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.63 
 
 
436 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.4 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.37 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  28.94 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.06 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.06 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.49 
 
 
431 aa  113  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  27.46 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.26 
 
 
424 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
417 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28 
 
 
474 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
417 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
423 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
413 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0903  major facilitator transporter  28.69 
 
 
413 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0920  major facilitator superfamily transporter  28.69 
 
 
413 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 
403 aa  104  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
425 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  28.53 
 
 
413 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  28.95 
 
 
426 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  26.75 
 
 
418 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  29.31 
 
 
412 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.88 
 
 
450 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  27.68 
 
 
414 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.61 
 
 
410 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
412 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  25.26 
 
 
413 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 
410 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  25.87 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  26.73 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  27.46 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  25.38 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.09 
 
 
446 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  25.84 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  26.14 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.64 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.64 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 
417 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
446 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.27 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  25.06 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.49 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
441 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.07 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  29.57 
 
 
491 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  22.67 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  26.02 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
442 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
461 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
405 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  24.31 
 
 
415 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
476 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
416 aa  90.1  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  24.05 
 
 
397 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  24.05 
 
 
397 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  24.53 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>