297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5391 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4879  major facilitator transporter  99.51 
 
 		 412 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  92.48 
 
 		 412 aa  737    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4699  major facilitator transporter  94.9 
 
 		 412 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5471  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5391  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667839  normal  0.033436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.23 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.49 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  29.71 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.42 
 
 		 446 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 447 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  30.3 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.93 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.74 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 418 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 412 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  29.23 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.33 
 
 		 431 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  25.63 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.75 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.49 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.06 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0903  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0920  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.09 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.05 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 476 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  27.23 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  25.6 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 403 aa  96.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 418 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  25.41 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  25.39 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  26.58 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 417 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.9 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>