More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl287 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl287  membrane associated Zn-dependent protease  100 
 
 
422 aa  849    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0142185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  30.51 
 
 
337 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  27.37 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
355 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.04 
 
 
357 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  24.46 
 
 
466 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.57 
 
 
347 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  25.94 
 
 
348 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  43.65 
 
 
349 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.2 
 
 
343 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.95 
 
 
448 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  27.29 
 
 
355 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.05 
 
 
461 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  24.88 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  24.95 
 
 
451 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.21 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  24.17 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  25.53 
 
 
456 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  25.18 
 
 
370 aa  94  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.81 
 
 
456 aa  93.6  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  25.77 
 
 
452 aa  93.6  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.64 
 
 
479 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  26.12 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  25.11 
 
 
457 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.94 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.79 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  43.24 
 
 
354 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.54 
 
 
453 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  25.12 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  25.16 
 
 
453 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.83 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  23.56 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  24.77 
 
 
408 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.13 
 
 
455 aa  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.89 
 
 
453 aa  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  38.97 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
362 aa  88.2  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.15 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  22.97 
 
 
454 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  22.62 
 
 
375 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  27.08 
 
 
450 aa  87  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  24.32 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  37.59 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  38.46 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  27.08 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  27.08 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.94 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.69 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  22.83 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.89 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  26.53 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  25.32 
 
 
452 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.54 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  22.96 
 
 
462 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  24.94 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  26.53 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  26.53 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  26.53 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  50 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  29.77 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  26.53 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  26.53 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.34 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  22.82 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.9 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.09 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.19 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  22.99 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  21.53 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  23.17 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.15 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.9 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  24.89 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  33.11 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.08 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.5 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  33.11 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.1 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  38.02 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  32.69 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  26.43 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.78 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  24.02 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  26.43 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  25.79 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  21.84 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  21.65 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  23.79 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  25.47 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  25.72 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  23.54 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  21.44 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.42 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  23.49 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  38.02 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>