87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0366 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  100 
 
 		 67 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  98.51 
 
 		 67 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  91.04 
 
 		 67 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  91.04 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  91.04 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  74.6 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  74.24 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  74.24 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  72.73 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  73.02 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  68.18 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  75.44 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  70.18 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  75.44 
 
 		 59 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  69.35 
 
 		 63 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  66.67 
 
 		 63 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  73.68 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  64.52 
 
 		 63 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  66.67 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  60 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  61.29 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  56.25 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  55.38 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  50.77 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  62 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  60.32 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  51.61 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  62.26 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  55.36 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  58.49 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  53.06 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  45.9 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  46.03 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  48.08 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  44.44 
 
 		 63 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  41.38 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  44.23 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  46 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  38.6 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  43.86 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  37.7 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  50.85 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  44.23 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.23 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  36.92 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  40.35 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  48.98 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  45.28 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  41.07 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  46.15 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  33.87 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  41.18 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  41.38 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  46.94 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  46.15 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  46.94 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  36.07 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  36.67 
 
 		 124 aa  42  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  43.4 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  36.67 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  35.71 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1276  CsbD-like protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1293  CsbD family protein  52.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48173  normal  0.157127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  42.37 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1305  CsbD family protein  45.65 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  34.43 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  46.94 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  37.74 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  39.62 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  38.6 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  40.74 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  36.36 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  44 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  38.71 
 
 		 79 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>