139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3663 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  64.29 
 
 		 61 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  52.73 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  52.73 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  50.91 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  52.73 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  51.79 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  50 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  48.33 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  55.36 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  49.12 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  53.57 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  46.43 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  45.61 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  47.46 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  38.98 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  38.98 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  38.98 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  44.64 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  45.76 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  50 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  50 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  41.07 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  45.76 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  48.28 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  41.82 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  45.61 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  45.61 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  38.98 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  44 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  47.37 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.64 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  41.38 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  43.86 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  42.62 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  42.62 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  38.6 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  44.23 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  44.64 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  38.6 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  40 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  37.74 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  36.84 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  49.09 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  46.81 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  42.11 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  39.34 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  37.7 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  46.94 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  41.67 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  37.29 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  36.84 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  43.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  46 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  44 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  42.37 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  42.31 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  42.59 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  42.11 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  42.37 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  38.98 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  39.34 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  44 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  40.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  40.68 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  42.37 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  35.09 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  37.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  41.67 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>