69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1345 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  100 
 
 
60 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  51.92 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  46.67 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  50.98 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  50.98 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  51.85 
 
 
57 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  52.54 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  47.37 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  48.15 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  52 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  46.43 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  47.17 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  40.68 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  48.08 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  42.59 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  46.3 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  46.15 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  42.59 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  48.08 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  38.98 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  45.1 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  45.28 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  43.4 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  39.34 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  42.59 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  42.59 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  42.59 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  43.64 
 
 
59 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  38.98 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  44.44 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  38.71 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  46.3 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  43.4 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  42.59 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  42.59 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  36.84 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  40.43 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  38.98 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  46.3 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  46.15 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  41.18 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  38.33 
 
 
61 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  41.18 
 
 
67 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  40.32 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  38.6 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0898  CsbD family protein  42.59 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1154  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  40.74 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  38.89 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  35.59 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  40.43 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  40 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  42.31 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  36.07 
 
 
67 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  36.07 
 
 
67 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  38.6 
 
 
63 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>