65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1596 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  88.71 
 
 		 63 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  85.48 
 
 		 63 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  82.76 
 
 		 59 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  79.31 
 
 		 59 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  79.31 
 
 		 59 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  79.31 
 
 		 59 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  73.02 
 
 		 67 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  73.02 
 
 		 67 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  65.08 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  66.67 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  66.67 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  74.14 
 
 		 59 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  63.49 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  65.08 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  63.49 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  63.49 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  58.06 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  60.32 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  58.73 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  58.73 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  58.06 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  57.14 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  58.73 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  57.14 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  60.71 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  58.93 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  57.14 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  54.1 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  60.38 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  58 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  48.28 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  48.94 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  44.83 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  49.06 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  42.11 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  49.06 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  44.83 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  47.06 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  47.27 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  41.82 
 
 		 56 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  43.4 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  46.43 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  47.27 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  48.08 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  40 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  41.18 
 
 		 58 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.23 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  46.15 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  35.59 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  37.93 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  34.48 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  38.46 
 
 		 124 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  33.9 
 
 		 65 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>