191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2041 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  100 
 
 
74 aa  141  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  52.38 
 
 
63 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  57.14 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  54.39 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  50.79 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  50.79 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  52.38 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  56.36 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  51.79 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  49.21 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  56.36 
 
 
56 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  53.57 
 
 
57 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  53.57 
 
 
57 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  45.16 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  54.55 
 
 
55 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  49.09 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  49.12 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  41.27 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  46.15 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  47.27 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  43.64 
 
 
61 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  47.54 
 
 
70 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  47.54 
 
 
70 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  43.86 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  48.33 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  43.64 
 
 
58 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  45.45 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  45.45 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  50.94 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  50.94 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  50.94 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  50.94 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  47.92 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  50.94 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  41.89 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  46.67 
 
 
67 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  49.06 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  43.64 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  51.92 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  43.64 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  50.98 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  47.17 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  48.08 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  47.27 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  41.82 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  45 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  50 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  50 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  40.62 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  39.44 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  41.82 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  41.82 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  43.64 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  42.11 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  45.45 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  42.86 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  41.67 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  42.11 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  42.11 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  38.6 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  42.31 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  40 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  45.45 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  42.59 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  38.18 
 
 
69 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  38.89 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  35.21 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  43.64 
 
 
67 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  38.18 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  40 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  40 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  35.21 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  33.9 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  42.11 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  36.36 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  45.45 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  38.89 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  34.43 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  43.08 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  43.66 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  38.89 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  38.89 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  42.62 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  40.35 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  40 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  33.8 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  36.36 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  44.23 
 
 
57 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  44.23 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  44.23 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  34.55 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  42.31 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  42.59 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  44.23 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  40.98 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  38.6 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  40 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  42.59 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  42.31 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>