71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2412 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  75.86 
 
 		 61 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  72.88 
 
 		 59 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  60.34 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  56.9 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  52.63 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  52.54 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  50.85 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  45.76 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  47.46 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  38.98 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  38.98 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  45.76 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  41.82 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  37.29 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  45.45 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  45.45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  45.45 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  43.14 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  37.29 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  36.36 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  34.55 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  41.82 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  38.18 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  40.35 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  36.36 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  40.68 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  44.64 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  38.98 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  40.68 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  43.64 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  41.18 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  37.29 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  35.71 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  41.18 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  37.29 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  39.62 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  38.6 
 
 		 65 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  35.59 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  40.35 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  35.59 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  36.21 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  33.9 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  38.18 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  35.59 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  32.14 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  39.62 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  38.98 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  39.62 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  32.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  36.36 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  35.85 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  35.19 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  35.85 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2337  hypothetical protein  57.58 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.042061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  30.36 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  41.51 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  34.55 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  38.18 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  30.91 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  38.46 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  36.54 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  38.18 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  39.22 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  32.73 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  29.09 
 
 		 69 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>