69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5643 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  100 
 
 		 80 aa  156  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  40 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  40 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  40 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  43.04 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  40.51 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  36.7 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  38.75 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  44.44 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  44.16 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  33.93 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  55.1 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3006  putative general stress response protein  37.18 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.652543  normal  0.570216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  50 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  51.85 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  41.67 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  44.83 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  44.83 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  38.98 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  53.06 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  37.1 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  40 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  36.21 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  50 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0610  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  44 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  37.1 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  44.83 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  44.83 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  38.98 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  38.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  48 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  44.44 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  40.74 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  41.38 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1706  hypothetical protein  37.97 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  40.74 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  35.85 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  33.93 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  29.36 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  42.59 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  43.75 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  40.82 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  37.14 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.89 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  44.44 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2222  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  43.64 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  41.51 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  41.82 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  30.28 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  37.04 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  39.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  38.78 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  38.89 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  30.28 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  45.83 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  45.83 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  43.75 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  37.04 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0808  hypothetical protein  37.33 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  41.51 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  36.07 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  42.59 
 
 		 66 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>