57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3274 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  100 
 
 		 69 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  71.93 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  73.68 
 
 		 61 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  65.52 
 
 		 59 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  59.65 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  52.63 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  53.57 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  52.63 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  55.1 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  52.63 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  50 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  51.79 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  51.79 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  49.12 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  33.85 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  35.94 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  37.5 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  34.92 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  38.46 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  41.18 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.18 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  43.64 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  38.33 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.33 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.33 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  46.43 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  30.65 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  38.18 
 
 		 57 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  31.94 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  39.29 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  34.55 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  32.81 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  29.03 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  36.67 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  32.81 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  36.67 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  30.51 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  29.69 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  36.36 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  29.69 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  34.55 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  29.03 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  35 
 
 		 82 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  40 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.4 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  36.21 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  36.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  34.43 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  32.14 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  35.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  40 
 
 		 69 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  38.1 
 
 		 64 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>