46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3895 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  100 
 
 		 58 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  82.76 
 
 		 58 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  77.59 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  77.59 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  52.73 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  47.27 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  47.92 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  41.82 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  37.5 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  45.45 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  43.64 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  41.07 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  41.18 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  38.18 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  40 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  41.67 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  41.18 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  36 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  41.67 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  33.93 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  38.33 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  32.73 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  31.58 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  31.58 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  38.18 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  34 
 
 		 63 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  34 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  38.46 
 
 		 63 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  33.93 
 
 		 70 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  42.86 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  39.58 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  42.86 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  42.86 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  39.58 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  31.58 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  39.58 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  34.55 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  34.55 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  37.25 
 
 		 131 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  39.58 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  35.42 
 
 		 124 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0468  CsbD family protein  43.75 
 
 		 59 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>