29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2023 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  100 
 
 		 68 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  98.53 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  98.53 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  58.82 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  41.27 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  40 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  40 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.89 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  42.31 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  39.34 
 
 		 63 aa  43.9  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  39.34 
 
 		 63 aa  43.9  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  39.62 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  40.38 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  36.84 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  40 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  36.36 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  41.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  42.31 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  42.86 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  44.9 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  44.64 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  42.31 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  44.9 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  42.31 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  47.06 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  42.59 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  38.89 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  38.46 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>