64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5331 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  72.13 
 
 		 63 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  70.97 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  70.97 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  70.49 
 
 		 63 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  70.91 
 
 		 57 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  61.02 
 
 		 59 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  56.9 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  53.45 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  52.54 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  46.15 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  49.12 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  46.15 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  41.82 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  35.48 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  50 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  34.48 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  35 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  35 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  42.11 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  42.11 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  42.19 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  41.82 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  43.64 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  40.74 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  44.44 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  49.02 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  42.86 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  40 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  47.27 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  38.18 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  38.46 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0165  hypothetical protein  44.9 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  45.28 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  42.59 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  41.82 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  35.09 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  36.36 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  34.38 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  35.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  38.98 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  42.86 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.18 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  38.89 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  38.89 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  35.71 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  37.04 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  38.89 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  41.82 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  37.29 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  37.29 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  37.5 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  36.07 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  32.76 
 
 		 118 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>