28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3681 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  100 
 
 		 82 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  97.56 
 
 		 82 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  91.46 
 
 		 82 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  40 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  38.98 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  41.07 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  35 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  34.67 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  35 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  35 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  38.89 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  40.74 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0610  hypothetical protein  29.27 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057785 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  36.36 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  36.67 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  33.9 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  36.67 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1759  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.25 
 
 		 90 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  36.36 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  38.3 
 
 		 59 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  31.67 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3006  putative general stress response protein  29.76 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.652543  normal  0.570216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  36.73 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  32.43 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  31.67 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  30 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>